设立“暑期学校”，构筑学生课外科技训练平台。从2002年起，学校开始实行新学期制（见南字发[2002]174号文件），根据“优化课内、强化课外”的教学原则，缩短学期周数（由20周缩减为18周），推动教师精简课堂教学内容，增加“暑期学校”（5周），其主要目的在于给予学生更多的时间与空间自主学习，通过安排一系列学生课外科研训练项目，拓宽知识面，充分发展个性，提高综合能力，从而推动教学质量的整体提高。在“暑期学校”期间，学校安排的科研训练活动主要包括：国内外知名学者开设的系列专题学术讲座，各级各类本科生科研训练项目研究，各类学术专题研习班，开放实验室自主实验，野外教学实践和社会实践，学生学术科技竞赛培训等。为了使“暑期学校”计划落到实处，学校特别出台了“暑期学校工作规程”（南字发[2003]30号文件），规定学生参加“暑期学校”教学活动，可以根据活动的时间和提交完整的读书报告获得一定的学分，学生参加课外科技学术文化竞赛活动，也可以获得相应的创新学分。从2004年至今，每年参加“暑期学校”活动的学生人数达到6000～8000人。

    建立“学生创新工程基地”。“学生创新工程基地建设”计划是南京大学“211工程”和“985工程”重点教学改革建设项目，依托校内“学生创新工程基地”，学校重点支持了一批有潜质的创新项目的研究与开发，特别是融知识与能力为一体的科技发明、科技制作、学术论文、社会调查等项目，以及一部分学科交叉、融合的项目，营造有利于创新人才脱颖而出的创新氛围和育人环境，进一步激发学生的创新思维，培养创新精神和创新能力。

结合全国“挑战杯”竞赛，我校每年都规划一批学生科研项目，学生们利用“创新工程基地”这个平台，自主选题并开展研究，有的还成立了课外科研攻关小组，在历届全国“挑战杯”科技作品竞赛和创业计划大赛中，我校学生都取得了较好的成绩，有许多成果转让给企业获得较高的经济效益。例如我校6件作品参加2002年第六届全国大学生“挑战杯”课外科技大赛，有5件作品获奖，其中3件作品由于科技含量高，应用前景广，被江苏省3家企业看中并高价买走。获得一等奖的“体内可降解吸收医用高分子材料及其制品”由南京协和塑胶有限公司以500万元另加20％的技术参股买断。获得二等奖的“运动车辆多媒体自动捕捉记录系统”被扬州国脉通信有限公司以580万元买走。另一项二等奖作品“电动自行车综合测试仪”技术以300万元转让给南京天地集团公司。

在2006年举行的第五届“挑战杯”中国大学生创业计划竞赛终审决赛中，南京大学的三支代表队荣获金奖二项、银奖一项，总成绩与其他两个高校并列第一位。我校获金奖的“威灵创业团队”研制开发了一种新型的农药残留检测仪，以先进方法取代原有技术，大幅度降低成本，有利于农药残留检测仪的广泛使用。另一支获得金奖的“巴迪奥创业团队”研制的产品，解决了高纯纳米钛酸钡长期以来依赖从国外进口的状况，填补了国内生产的空白。

实施“大学生创新训练计划” 。2006年南京大学推出了“大学生创新训练”计划。该计划旨在引导学生自主发现自己的能力和兴趣，最大限度地发展自己的智力和潜能，并形成一种终身学习的能力，以便在今后的生活中更好地发展知识、服务社会。该项计划进一步扩大了学生参与科研训练的覆盖面，项目在导师的指导下，直接由学生本人负责，项目研究经费也由学生自主支配，极大的调动了学生参与科学研究的积极性、主动性和创造性。2006年，我校作为全国首批“大学生创新训练计划”试点高校（全国十所），共有37个项目获得资助。2007年，我校启动了 “南京大学大学生创新训练计划”，共评选出资助项目140项，重点资助70项，一般资助70项，参与学生达到560多人，其中70个项目入选教育部资助计划，18个项目入选江苏省教育厅资助计划。

为更加有效地组织好项目的开展，我校专门下发了《南京大学“国家大学生创新训练计划”实施细则》，建立了指导学生开展创新训练的组织和领导机构，完善了项目管理体系。我校在大学生创新训练实施过程中的做法得到了教育主管部门的肯定，2007年6月和10月我校应邀分别在60所高校国家级大学生创新训练项目启动会和经验交流会上作大会发言，引起较大反响。

开设高水平学术讲座或演讲。南京大学面向全校学生开设的学术讲座主要通过三种渠道安排：一是由学校教务处统一组织，统一安排，主要由校内有关教师开出，在新校区每周一般安排2次，内容以文、史、哲、艺术以及各学科前沿发展为主；二是由校文化艺术教育中心组织，通常一周安排1-2次，一般以聘请校外著名专家、学者、社会活动家和艺术家以及各界名流主讲，如杨振宁、李远哲、殷承宗、余秋雨、汪道涵等知名专家都来校作过讲座。近四年来，就有近20多位不同学科、不同国籍的诺贝尔奖获得者和近100多位国内外世界级著名科学家、文学家、经济学家、艺术家来访开设讲座和演讲。通常情况下，如果专家只讲一场，就特意放在浦口校区，以重点满足本科低年级同学的需要，若讲两场，则浦口校区和鼓楼校区各安排一场。仅在2007年暑期，就有来自美国、德国、日本、瑞典、韩国、新加坡等国30余名国际知名学者开设专题讲座；三是由各院系及有关社会、人文、法律等学科的研究所向全校开出素质教育讲座，大部分都安排在浦口校区进行。每个院系一学期至少要开出10-15个讲座。如商学院与文学院合作开设的“市场经济与中国传统文化系列讲座”（共有12讲）；历史学系、中国语言文学系联合开设的“香港的历史，现状与未来”系列讲座（共有7讲）以及院士系列讲座等。特别值得一提的是，我校开设的许多艺术欣赏类讲座更具有特色。学校每学期都邀请知名艺术团体和知名艺术家来校开设讲座，近十年来，由我校文化艺术教育中心举办的“人文艺术系列讲座”已经连续举办了350场。艺术家们依据不同艺术门类的特色和特点，边讲边演，讲解生动，表演精湛，使学生不但了解到不同艺术门类的知识，同时受到美的享受。