南京大学历来重视毕业生的就业工作，1999 年在全国率先成立了学生就业创业指导中心（简称“就业中心”），专门服务于大学生的就业，其下设的学士后流动站还对有创业意愿和创业能力的大学生提供咨询和支持。就业中心多层次多方位地对大学生进行职业规划教育和就业择业指导：在全校开设就业指导选修课程，帮助大学生制定个性化的生涯发展规划；定期邀请知名校友、企业家、人力资源总监、管理咨询公司负责人、成功择业的同学来学校开展各类讲座、报告会、沙龙；组织诸如“领袖训练营”、“职场精英”等主题活动。力争使“一流的生源”在“一流的培养”后得到“一流的就业”。

就业中心每年定期组织校内大型招聘会，供学生和企业双向选择，每年接待和联络的用人单位近千个，有效需求岗位数远远超出学校毕业生的数量，需求数与毕业生数之比约为3.5：1。由于南京大学的毕业生具有扎实的专业功底和较为全面的综合素质，一直成为各大用人单位争夺的对象。毕业生主要流向为：1、按就业类别：升学、出国48%；2、按地区流向：70%在长三角地区，20%在珠三角地区，其他同学也主要集中在省会城市和国家重点企业；3、按行业流向：公务员4%，科研院所及其他事业单位40%，金融出版等15%，世界500 强及国内大型企业占18%，其他企业20%，自由职业及自主创业3%。

招聘单位主要有：国务院、外交部、国安部、有关省委省政府、国内外各大银行、国际四大著名会计事务所、出版集团、广电集团、报业集团、世界500 强企业（如宝洁、高露洁、微软、福特汽车、通用电器等）、国内百强企业（如华为、中兴、腾讯、海尔、联想、中石油等）、国内外著名咨询机构、军工企业、气象及规划等部门。